1、国公立大学：包括了国立大学和公立大学。公立大学和国立大学都是国家支持的学校，国立大学学费较低，但难以进入，世界学术排名较高。公立大学由地方政府出资建立，招生规模较小，专业设置注重学术研究。毕业后在本地就业有优势。
2、私立大学是由民间资本维持经营的学校，学费较高，但设施好，政策灵活。这类学校注重培养学生的社会实践能力，知名度和学术水平普遍较高。
3、短期大学通常是2年制，也有3年制的护士和医疗技术专业。与专门学校相比，短期大学的课程更加偏向理论，并且女生比例较高。
4、专门学校也被称为专修学校或高等职业学校，注重培养学生的职业教育和实际生活所需的技能和知识，学制一般为1-3年。
5、语言学校是帮助学习日语和适应日本生活的全方位辅导机构。除了各类语言课程，还提供升学和就业辅导。
6、学部相当于国内的学院或系，本科学业通常需要在学部阶段完成，学制一般为4年，医学、药学等学制为6年。
7、大学院相当于中国的研究生院，硕士期间毕业后可以深造，博士期间毕业是继续深造的好机会。