要分情况看，简单的答案是：原则上认可，但实际审查中差别很大，对工作签证（人文签证）来说，成人学历的过签率非常低。
入管局的官方立场
日本入管局在审查规定中并未明文区分「全日制」和「非全日制」，原则上承认中国教育部认可、学信网可查的所有学历。但在实际操作中，审查官会看毕业证上记载的「学制」「修业年限」，而成人学历的毕业证往往与全日制不同，会被认定为「不等同于正规大学学历」。
按签证类型区分
工作签证（技术·人文知识·国际业务）
这是最严格的类型，对成人学历几乎是关闭的：
- 成人/自考/函授/电大大专：基本无法过签。日本企业几乎不会招聘，即使被录用，递交入管局后拒签率极高，目前在国内招聘赴日工作的几乎100%不要非全日制大专学历。
- 自考/成人本科+学位证（双证齐全）：有机会申请，但审查较严，需要专业与岗位高度相关。
- 自考/成人本科只有毕业证、没有学位证：基本无望。
几个常被问到的细节
学信网可查是必要条件，但不是充分条件。仅"可查"并不等于入管局会认可对应签证类别。
第一学历会被重点关注。如果第一学历是初中，后续学历的认可度会进一步下降；如果第一学历是高中，自考本科+学位证仍有一定希望。
专业相关性很重要。即使是统招大专，专业与赴日工作内容不对口也会被拒签；非全日制学历在这一点上的审查更严。